Attīstoties mūsdienu zinātnei un tehnoloģijām, endoskopi tika pilnībā pārveidoti, iekļaujot optiskās šķiedras. 1963. gadā Japāna sāka ražot optisko šķiedru endoskopus, un 1964. gadā tika veiksmīgi izstrādāta optisko šķiedru endoskopu biopsijas iekārta. Šīs īpašās biopsijas knaibles ļauj iegūt piemērotus patoloģiskos paraugus ar minimālu risku. 1965. gadā tika izstrādāts optisko šķiedru kolonoskops, paplašinot kuņģa-zarnu trakta apakšējo slimību izmeklēšanas jomu. Pētījumi sākās 1967. gadā par palielināmo optisko šķiedru endoskopu, lai novērotu sīkus bojājumus. Optisko šķiedru endoskopus var izmantot arī in vivo laboratorijas testiem, piemēram, ķermeņa temperatūras, spiediena, nobīdes, spektrālās absorbcijas un citu datu mērīšanai.
1973. gadā lāzertehnoloģijas tika pielietotas endoskopiskai ārstēšanai un pakāpeniski kļuva par vienu no metodēm kuņģa-zarnu trakta asiņošanas ārstēšanā endoskopiski. 1981. gadā veiksmīgi tika izstrādāta endoskopiskās ultraskaņas tehnoloģija. Šī jaunā izstrāde, kas apvieno progresīvu ultraskaņas tehnoloģiju ar endoskopiju, ievērojami palielināja bojājumu diagnostikas precizitāti.
2002. gada novembrī radās pasaulē pirmā "augstas-izšķirtspējas endoskopu sistēma", kas krasi mainīja endoskopijas koncepciju. Tajā ir iekļauta visprogresīvākā-attēlveidošanas tehnoloģija, kas nodrošina attēla precizitāti, kas ļauj diagnosticēt ārkārtīgi mazus bojājumus. Mūsdienu video endoskopu, elektronisko endoskopu un ultraskaņas endoskopu parādīšanās ir ievadījusi jaunu modernās medicīniskās endoskopijas ēru, pārejot no izmeklēšanas un diagnostikas laikmeta uz ārstēšanas un ķirurģijas laikmetu.
